Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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