Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms