Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms