Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB6Q9BUF5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms