Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
C2orf88Q9BSF0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms