Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX2Q9BQ50 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms