Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms