Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM227BQ96M60 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM227BQ96M60 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms