Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTV1Q96GA3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms