Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms