Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC1Q96C34 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms