Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms