Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF3Q92576 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PHF3Q92576 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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