Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM41Q8WV44 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms