Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms