Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms