Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP43Q70EL4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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