Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms