Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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