Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms