Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms