Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms