Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms