Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms