Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms