Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms