Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms