Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms