Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms