Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FHOD3Q2V2M9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FHOD3Q2V2M9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms