Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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