Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IMPG1Q17R60 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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