Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAMK4Q16566 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms