Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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