Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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IRF4Q15306 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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