Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRKQ15262 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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