Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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