Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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