Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms