Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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