Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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