Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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