Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM25Q14258 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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