Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBFBQ13951 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBFBQ13951 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms