Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDX39BQ13838 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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