Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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