Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms