Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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