Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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