Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TUBB3Q13509 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TUBB3Q13509 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TUBB3Q13509 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TUBB3Q13509 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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